Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO5AQ8N6Q1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO5AQ8N6Q1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO5AQ8N6Q1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO5AQ8N6Q1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5AQ8N6Q1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5AQ8N6Q1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO5AQ8N6Q1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5AQ8N6Q1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5AQ8N6Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5AQ8N6Q1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO5AQ8N6Q1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO5AQ8N6Q1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO5AQ8N6Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO5AQ8N6Q1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO5AQ8N6Q1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO5AQ8N6Q1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO5AQ8N6Q1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCO5AQ8N6Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO5AQ8N6Q1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO5AQ8N6Q1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO5AQ8N6Q1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO5AQ8N6Q1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCO5AQ8N6Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO5AQ8N6Q1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO5AQ8N6Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO5AQ8N6Q1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO5AQ8N6Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO5AQ8N6Q1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO5AQ8N6Q1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO5AQ8N6Q1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO5AQ8N6Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO5AQ8N6Q1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMCO5AQ8N6Q1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5AQ8N6Q1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5AQ8N6Q1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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