Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF182Q8N6D2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF182Q8N6D2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF182Q8N6D2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF182Q8N6D2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF182Q8N6D2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms