Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B5

PRR18, Proline-rich protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR18Q8N4B5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR18Q8N4B5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR18Q8N4B5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR18Q8N4B5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRR18Q8N4B5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR18Q8N4B5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR18Q8N4B5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR18Q8N4B5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR18Q8N4B5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR18Q8N4B5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR18Q8N4B5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR18Q8N4B5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR18Q8N4B5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR18Q8N4B5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR18Q8N4B5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRR18Q8N4B5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRR18Q8N4B5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRR18Q8N4B5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRR18Q8N4B5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRR18Q8N4B5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRR18Q8N4B5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRR18Q8N4B5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRR18Q8N4B5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRR18Q8N4B5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRR18Q8N4B5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRR18Q8N4B5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR18Q8N4B5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR18Q8N4B5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRR18Q8N4B5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR18Q8N4B5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR18Q8N4B5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR18Q8N4B5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR18Q8N4B5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR18Q8N4B5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR18Q8N4B5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR18Q8N4B5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRR18Q8N4B5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms