Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N2

DYNAP, Dynactin-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNAPQ8N1N2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNAPQ8N1N2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNAPQ8N1N2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DYNAPQ8N1N2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNAPQ8N1N2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNAPQ8N1N2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNAPQ8N1N2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNAPQ8N1N2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNAPQ8N1N2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNAPQ8N1N2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNAPQ8N1N2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DYNAPQ8N1N2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNAPQ8N1N2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNAPQ8N1N2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNAPQ8N1N2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNAPQ8N1N2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNAPQ8N1N2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNAPQ8N1N2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNAPQ8N1N2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNAPQ8N1N2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNAPQ8N1N2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNAPQ8N1N2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNAPQ8N1N2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNAPQ8N1N2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNAPQ8N1N2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNAPQ8N1N2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DYNAPQ8N1N2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DYNAPQ8N1N2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms