Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00528Q8N1L1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00528Q8N1L1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00528Q8N1L1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00528Q8N1L1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00528Q8N1L1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00528Q8N1L1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00528Q8N1L1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00528Q8N1L1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00528Q8N1L1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00528Q8N1L1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00528Q8N1L1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00528Q8N1L1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00528Q8N1L1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00528Q8N1L1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00528Q8N1L1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms