Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC103Q8IW40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC103Q8IW40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC103Q8IW40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC103Q8IW40 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC103Q8IW40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC103Q8IW40 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC103Q8IW40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC103Q8IW40 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC103Q8IW40 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC103Q8IW40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC103Q8IW40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC103Q8IW40 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC103Q8IW40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC103Q8IW40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC103Q8IW40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC103Q8IW40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC103Q8IW40 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC103Q8IW40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC103Q8IW40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC103Q8IW40 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC103Q8IW40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC103Q8IW40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC103Q8IW40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC103Q8IW40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC103Q8IW40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC103Q8IW40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC103Q8IW40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC103Q8IW40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC103Q8IW40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms