Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM7

LINC00346, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00346, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00346Q8IVM7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00346Q8IVM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00346Q8IVM7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00346Q8IVM7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00346Q8IVM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00346Q8IVM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00346Q8IVM7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00346Q8IVM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00346Q8IVM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00346Q8IVM7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00346Q8IVM7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00346Q8IVM7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00346Q8IVM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00346Q8IVM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00346Q8IVM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00346Q8IVM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00346Q8IVM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00346Q8IVM7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00346Q8IVM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00346Q8IVM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00346Q8IVM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00346Q8IVM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00346Q8IVM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00346Q8IVM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00346Q8IVM7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00346Q8IVM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00346Q8IVM7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00346Q8IVM7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00346Q8IVM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00346Q8IVM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00346Q8IVM7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00346Q8IVM7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00346Q8IVM7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00346Q8IVM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00346Q8IVM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00346Q8IVM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00346Q8IVM7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00346Q8IVM7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00346Q8IVM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00346Q8IVM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00346Q8IVM7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00346Q8IVM7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00346Q8IVM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00346Q8IVM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00346Q8IVM7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00346Q8IVM7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00346Q8IVM7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00346Q8IVM7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00346Q8IVM7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00346Q8IVM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00346Q8IVM7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00346Q8IVM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00346Q8IVM7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms