Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CROCCP3Q8IVE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CROCCP3Q8IVE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CROCCP3Q8IVE0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CROCCP3Q8IVE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROCCP3Q8IVE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CROCCP3Q8IVE0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CROCCP3Q8IVE0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CROCCP3Q8IVE0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROCCP3Q8IVE0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CROCCP3Q8IVE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CROCCP3Q8IVE0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CROCCP3Q8IVE0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROCCP3Q8IVE0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CROCCP3Q8IVE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CROCCP3Q8IVE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CROCCP3Q8IVE0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CROCCP3Q8IVE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CROCCP3Q8IVE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CROCCP3Q8IVE0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CROCCP3Q8IVE0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CROCCP3Q8IVE0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CROCCP3Q8IVE0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CROCCP3Q8IVE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CROCCP3Q8IVE0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CROCCP3Q8IVE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CROCCP3Q8IVE0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROCCP3Q8IVE0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROCCP3Q8IVE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROCCP3Q8IVE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CROCCP3Q8IVE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CROCCP3Q8IVE0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CROCCP3Q8IVE0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CROCCP3Q8IVE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROCCP3Q8IVE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CROCCP3Q8IVE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCP3Q8IVE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROCCP3Q8IVE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROCCP3Q8IVE0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCP3Q8IVE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROCCP3Q8IVE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CROCCP3Q8IVE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROCCP3Q8IVE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROCCP3Q8IVE0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROCCP3Q8IVE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROCCP3Q8IVE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROCCP3Q8IVE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CROCCP3Q8IVE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROCCP3Q8IVE0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CROCCP3Q8IVE0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms