Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
PPARGC1BQ86YN6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
PPARGC1BQ86YN6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
PPARGC1BQ86YN6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
PPARGC1BQ86YN6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
PPARGC1BQ86YN6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
PPARGC1BQ86YN6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
PPARGC1BQ86YN6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PPARGC1BQ86YN6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
PPARGC1BQ86YN6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PPARGC1BQ86YN6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
PPARGC1BQ86YN6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
PPARGC1BQ86YN6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
PPARGC1BQ86YN6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
PPARGC1BQ86YN6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PPARGC1BQ86YN6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
PPARGC1BQ86YN6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PPARGC1BQ86YN6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PPARGC1BQ86YN6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC44.9■■■■■ 4.78
PPARGC1BQ86YN6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
PPARGC1BQ86YN6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
PPARGC1BQ86YN6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
PPARGC1BQ86YN6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
PPARGC1BQ86YN6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PPARGC1BQ86YN6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PPARGC1BQ86YN6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PPARGC1BQ86YN6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
PPARGC1BQ86YN6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
PPARGC1BQ86YN6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
PPARGC1BQ86YN6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
PPARGC1BQ86YN6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
PPARGC1BQ86YN6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
PPARGC1BQ86YN6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
PPARGC1BQ86YN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
PPARGC1BQ86YN6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
PPARGC1BQ86YN6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
PPARGC1BQ86YN6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
PPARGC1BQ86YN6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
PPARGC1BQ86YN6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PPARGC1BQ86YN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PPARGC1BQ86YN6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PPARGC1BQ86YN6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PPARGC1BQ86YN6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PPARGC1BQ86YN6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
PPARGC1BQ86YN6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
PPARGC1BQ86YN6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
PPARGC1BQ86YN6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PPARGC1BQ86YN6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
PPARGC1BQ86YN6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
PPARGC1BQ86YN6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PPARGC1BQ86YN6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PPARGC1BQ86YN6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
PPARGC1BQ86YN6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PPARGC1BQ86YN6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
PPARGC1BQ86YN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PPARGC1BQ86YN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
PPARGC1BQ86YN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PPARGC1BQ86YN6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
PPARGC1BQ86YN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
PPARGC1BQ86YN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PPARGC1BQ86YN6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PPARGC1BQ86YN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
PPARGC1BQ86YN6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PPARGC1BQ86YN6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
PPARGC1BQ86YN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms