Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PACS2Q86VP3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PACS2Q86VP3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PACS2Q86VP3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PACS2Q86VP3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PACS2Q86VP3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PACS2Q86VP3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PACS2Q86VP3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PACS2Q86VP3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PACS2Q86VP3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PACS2Q86VP3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PACS2Q86VP3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PACS2Q86VP3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PACS2Q86VP3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PACS2Q86VP3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PACS2Q86VP3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PACS2Q86VP3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PACS2Q86VP3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PACS2Q86VP3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PACS2Q86VP3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PACS2Q86VP3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PACS2Q86VP3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PACS2Q86VP3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PACS2Q86VP3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PACS2Q86VP3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PACS2Q86VP3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PACS2Q86VP3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PACS2Q86VP3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PACS2Q86VP3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PACS2Q86VP3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PACS2Q86VP3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PACS2Q86VP3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PACS2Q86VP3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PACS2Q86VP3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PACS2Q86VP3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PACS2Q86VP3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PACS2Q86VP3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PACS2Q86VP3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PACS2Q86VP3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PACS2Q86VP3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PACS2Q86VP3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PACS2Q86VP3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PACS2Q86VP3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PACS2Q86VP3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PACS2Q86VP3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PACS2Q86VP3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PACS2Q86VP3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PACS2Q86VP3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PACS2Q86VP3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms