Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z699

SPRED1, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1Q7Z699 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPRED1Q7Z699 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPRED1Q7Z699 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPRED1Q7Z699 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPRED1Q7Z699 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPRED1Q7Z699 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SPRED1Q7Z699 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPRED1Q7Z699 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRED1Q7Z699 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRED1Q7Z699 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRED1Q7Z699 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRED1Q7Z699 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRED1Q7Z699 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRED1Q7Z699 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPRED1Q7Z699 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRED1Q7Z699 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRED1Q7Z699 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRED1Q7Z699 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRED1Q7Z699 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRED1Q7Z699 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRED1Q7Z699 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRED1Q7Z699 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRED1Q7Z699 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRED1Q7Z699 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRED1Q7Z699 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRED1Q7Z699 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRED1Q7Z699 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRED1Q7Z699 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRED1Q7Z699 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPRED1Q7Z699 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPRED1Q7Z699 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPRED1Q7Z699 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPRED1Q7Z699 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPRED1Q7Z699 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPRED1Q7Z699 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPRED1Q7Z699 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPRED1Q7Z699 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPRED1Q7Z699 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPRED1Q7Z699 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPRED1Q7Z699 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPRED1Q7Z699 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPRED1Q7Z699 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPRED1Q7Z699 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPRED1Q7Z699 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPRED1Q7Z699 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPRED1Q7Z699 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPRED1Q7Z699 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPRED1Q7Z699 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPRED1Q7Z699 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPRED1Q7Z699 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPRED1Q7Z699 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPRED1Q7Z699 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPRED1Q7Z699 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPRED1Q7Z699 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPRED1Q7Z699 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRED1Q7Z699 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SPRED1Q7Z699 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRED1Q7Z699 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms