Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC3Q7RTR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC3Q7RTR2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC3Q7RTR2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC3Q7RTR2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC3Q7RTR2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRC3Q7RTR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC3Q7RTR2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC3Q7RTR2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC3Q7RTR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC3Q7RTR2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC3Q7RTR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC3Q7RTR2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC3Q7RTR2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC3Q7RTR2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC3Q7RTR2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRC3Q7RTR2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC3Q7RTR2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC3Q7RTR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC3Q7RTR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC3Q7RTR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC3Q7RTR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC3Q7RTR2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC3Q7RTR2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC3Q7RTR2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC3Q7RTR2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC3Q7RTR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRC3Q7RTR2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRC3Q7RTR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRC3Q7RTR2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRC3Q7RTR2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC3Q7RTR2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRC3Q7RTR2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRC3Q7RTR2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRC3Q7RTR2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms