Protein–RNA interactions for Protein: Q76KD6

SPATC1, Speriolin, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATC1Q76KD6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPATC1Q76KD6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPATC1Q76KD6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATC1Q76KD6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATC1Q76KD6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATC1Q76KD6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATC1Q76KD6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATC1Q76KD6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATC1Q76KD6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATC1Q76KD6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPATC1Q76KD6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATC1Q76KD6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATC1Q76KD6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATC1Q76KD6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPATC1Q76KD6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPATC1Q76KD6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPATC1Q76KD6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPATC1Q76KD6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPATC1Q76KD6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPATC1Q76KD6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPATC1Q76KD6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPATC1Q76KD6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPATC1Q76KD6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPATC1Q76KD6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPATC1Q76KD6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPATC1Q76KD6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATC1Q76KD6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPATC1Q76KD6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPATC1Q76KD6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATC1Q76KD6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATC1Q76KD6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATC1Q76KD6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATC1Q76KD6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATC1Q76KD6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATC1Q76KD6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATC1Q76KD6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATC1Q76KD6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATC1Q76KD6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATC1Q76KD6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATC1Q76KD6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATC1Q76KD6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATC1Q76KD6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATC1Q76KD6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATC1Q76KD6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATC1Q76KD6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATC1Q76KD6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATC1Q76KD6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATC1Q76KD6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATC1Q76KD6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATC1Q76KD6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATC1Q76KD6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATC1Q76KD6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms