Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL4BQ6ZWI9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL4BQ6ZWI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL4BQ6ZWI9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL4BQ6ZWI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL4BQ6ZWI9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL4BQ6ZWI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL4BQ6ZWI9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms