Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
UBR3Q6ZT12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
UBR3Q6ZT12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
UBR3Q6ZT12 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
UBR3Q6ZT12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
UBR3Q6ZT12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
UBR3Q6ZT12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
UBR3Q6ZT12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
UBR3Q6ZT12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
UBR3Q6ZT12 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
UBR3Q6ZT12 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
UBR3Q6ZT12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
UBR3Q6ZT12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBR3Q6ZT12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBR3Q6ZT12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBR3Q6ZT12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBR3Q6ZT12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBR3Q6ZT12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBR3Q6ZT12 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBR3Q6ZT12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
UBR3Q6ZT12 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
UBR3Q6ZT12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
UBR3Q6ZT12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
UBR3Q6ZT12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
UBR3Q6ZT12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
UBR3Q6ZT12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
UBR3Q6ZT12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
UBR3Q6ZT12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
UBR3Q6ZT12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
UBR3Q6ZT12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBR3Q6ZT12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
UBR3Q6ZT12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
UBR3Q6ZT12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBR3Q6ZT12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBR3Q6ZT12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
UBR3Q6ZT12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBR3Q6ZT12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
UBR3Q6ZT12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
UBR3Q6ZT12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
UBR3Q6ZT12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
UBR3Q6ZT12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
UBR3Q6ZT12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
UBR3Q6ZT12 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
UBR3Q6ZT12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
UBR3Q6ZT12 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
UBR3Q6ZT12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
UBR3Q6ZT12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
UBR3Q6ZT12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
UBR3Q6ZT12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
UBR3Q6ZT12 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
UBR3Q6ZT12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
UBR3Q6ZT12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
UBR3Q6ZT12 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
UBR3Q6ZT12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
UBR3Q6ZT12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
UBR3Q6ZT12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
UBR3Q6ZT12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBR3Q6ZT12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
UBR3Q6ZT12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
UBR3Q6ZT12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
UBR3Q6ZT12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
UBR3Q6ZT12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
UBR3Q6ZT12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
UBR3Q6ZT12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
UBR3Q6ZT12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
UBR3Q6ZT12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
UBR3Q6ZT12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
UBR3Q6ZT12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
UBR3Q6ZT12 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
UBR3Q6ZT12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
UBR3Q6ZT12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
UBR3Q6ZT12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
UBR3Q6ZT12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
UBR3Q6ZT12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
UBR3Q6ZT12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
UBR3Q6ZT12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
UBR3Q6ZT12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms