Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MFSD6Q6ZSS7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MFSD6Q6ZSS7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
MFSD6Q6ZSS7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MFSD6Q6ZSS7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MFSD6Q6ZSS7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MFSD6Q6ZSS7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
MFSD6Q6ZSS7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MFSD6Q6ZSS7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MFSD6Q6ZSS7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MFSD6Q6ZSS7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MFSD6Q6ZSS7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MFSD6Q6ZSS7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MFSD6Q6ZSS7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MFSD6Q6ZSS7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
MFSD6Q6ZSS7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MFSD6Q6ZSS7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MFSD6Q6ZSS7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MFSD6Q6ZSS7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MFSD6Q6ZSS7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MFSD6Q6ZSS7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MFSD6Q6ZSS7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MFSD6Q6ZSS7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MFSD6Q6ZSS7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MFSD6Q6ZSS7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MFSD6Q6ZSS7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MFSD6Q6ZSS7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MFSD6Q6ZSS7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.78■■■■□ 3
MFSD6Q6ZSS7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
MFSD6Q6ZSS7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MFSD6Q6ZSS7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MFSD6Q6ZSS7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MFSD6Q6ZSS7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MFSD6Q6ZSS7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MFSD6Q6ZSS7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MFSD6Q6ZSS7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MFSD6Q6ZSS7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MFSD6Q6ZSS7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MFSD6Q6ZSS7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MFSD6Q6ZSS7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MFSD6Q6ZSS7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MFSD6Q6ZSS7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
MFSD6Q6ZSS7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MFSD6Q6ZSS7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MFSD6Q6ZSS7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MFSD6Q6ZSS7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MFSD6Q6ZSS7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MFSD6Q6ZSS7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MFSD6Q6ZSS7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MFSD6Q6ZSS7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MFSD6Q6ZSS7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MFSD6Q6ZSS7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MFSD6Q6ZSS7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MFSD6Q6ZSS7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
MFSD6Q6ZSS7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MFSD6Q6ZSS7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MFSD6Q6ZSS7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MFSD6Q6ZSS7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MFSD6Q6ZSS7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MFSD6Q6ZSS7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MFSD6Q6ZSS7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MFSD6Q6ZSS7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MFSD6Q6ZSS7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MFSD6Q6ZSS7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MFSD6Q6ZSS7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MFSD6Q6ZSS7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MFSD6Q6ZSS7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MFSD6Q6ZSS7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MFSD6Q6ZSS7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms