Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEX3BQ6ZN04 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEX3BQ6ZN04 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MEX3BQ6ZN04 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEX3BQ6ZN04 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEX3BQ6ZN04 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEX3BQ6ZN04 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEX3BQ6ZN04 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEX3BQ6ZN04 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEX3BQ6ZN04 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEX3BQ6ZN04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEX3BQ6ZN04 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEX3BQ6ZN04 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEX3BQ6ZN04 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEX3BQ6ZN04 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEX3BQ6ZN04 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEX3BQ6ZN04 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEX3BQ6ZN04 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEX3BQ6ZN04 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEX3BQ6ZN04 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEX3BQ6ZN04 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEX3BQ6ZN04 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEX3BQ6ZN04 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MEX3BQ6ZN04 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MEX3BQ6ZN04 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MEX3BQ6ZN04 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEX3BQ6ZN04 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEX3BQ6ZN04 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEX3BQ6ZN04 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEX3BQ6ZN04 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEX3BQ6ZN04 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEX3BQ6ZN04 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MEX3BQ6ZN04 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEX3BQ6ZN04 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEX3BQ6ZN04 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEX3BQ6ZN04 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEX3BQ6ZN04 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEX3BQ6ZN04 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEX3BQ6ZN04 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEX3BQ6ZN04 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MEX3BQ6ZN04 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEX3BQ6ZN04 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEX3BQ6ZN04 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEX3BQ6ZN04 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MEX3BQ6ZN04 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MEX3BQ6ZN04 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MEX3BQ6ZN04 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEX3BQ6ZN04 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEX3BQ6ZN04 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEX3BQ6ZN04 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEX3BQ6ZN04 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms