Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN7

TOMM20L, TOMM20-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20LQ6UXN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOMM20LQ6UXN7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOMM20LQ6UXN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOMM20LQ6UXN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOMM20LQ6UXN7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOMM20LQ6UXN7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOMM20LQ6UXN7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOMM20LQ6UXN7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TOMM20LQ6UXN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM20LQ6UXN7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOMM20LQ6UXN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOMM20LQ6UXN7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOMM20LQ6UXN7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOMM20LQ6UXN7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOMM20LQ6UXN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOMM20LQ6UXN7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOMM20LQ6UXN7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOMM20LQ6UXN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOMM20LQ6UXN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOMM20LQ6UXN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOMM20LQ6UXN7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOMM20LQ6UXN7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM20LQ6UXN7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM20LQ6UXN7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM20LQ6UXN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM20LQ6UXN7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOMM20LQ6UXN7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOMM20LQ6UXN7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOMM20LQ6UXN7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOMM20LQ6UXN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOMM20LQ6UXN7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOMM20LQ6UXN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM20LQ6UXN7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOMM20LQ6UXN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOMM20LQ6UXN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM20LQ6UXN7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM20LQ6UXN7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms