Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCBE1Q6UXH8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCBE1Q6UXH8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCBE1Q6UXH8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCBE1Q6UXH8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCBE1Q6UXH8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCBE1Q6UXH8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCBE1Q6UXH8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCBE1Q6UXH8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCBE1Q6UXH8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCBE1Q6UXH8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCBE1Q6UXH8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCBE1Q6UXH8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCBE1Q6UXH8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCBE1Q6UXH8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCBE1Q6UXH8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCBE1Q6UXH8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCBE1Q6UXH8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCBE1Q6UXH8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCBE1Q6UXH8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCBE1Q6UXH8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCBE1Q6UXH8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCBE1Q6UXH8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCBE1Q6UXH8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCBE1Q6UXH8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCBE1Q6UXH8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCBE1Q6UXH8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCBE1Q6UXH8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCBE1Q6UXH8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCBE1Q6UXH8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCBE1Q6UXH8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCBE1Q6UXH8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCBE1Q6UXH8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCBE1Q6UXH8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCBE1Q6UXH8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCBE1Q6UXH8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms