Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R4Q6NUP7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP4R4Q6NUP7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP4R4Q6NUP7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP4R4Q6NUP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP4R4Q6NUP7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP4R4Q6NUP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP4R4Q6NUP7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP4R4Q6NUP7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP4R4Q6NUP7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP4R4Q6NUP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP4R4Q6NUP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP4R4Q6NUP7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP4R4Q6NUP7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP4R4Q6NUP7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP4R4Q6NUP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP4R4Q6NUP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP4R4Q6NUP7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP4R4Q6NUP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP4R4Q6NUP7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP4R4Q6NUP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R4Q6NUP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R4Q6NUP7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R4Q6NUP7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R4Q6NUP7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R4Q6NUP7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP4R4Q6NUP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R4Q6NUP7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R4Q6NUP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP4R4Q6NUP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP4R4Q6NUP7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP4R4Q6NUP7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R4Q6NUP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP4R4Q6NUP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R4Q6NUP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4Q6NUP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R4Q6NUP7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP4R4Q6NUP7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4R4Q6NUP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R4Q6NUP7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R4Q6NUP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R4Q6NUP7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R4Q6NUP7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R4Q6NUP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP4R4Q6NUP7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP4R4Q6NUP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP4R4Q6NUP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP4R4Q6NUP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP4R4Q6NUP7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP4R4Q6NUP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP4R4Q6NUP7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP4R4Q6NUP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms