Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPRIN2Q6IMN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPRIN2Q6IMN6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPRIN2Q6IMN6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPRIN2Q6IMN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPRIN2Q6IMN6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPRIN2Q6IMN6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPRIN2Q6IMN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPRIN2Q6IMN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPRIN2Q6IMN6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPRIN2Q6IMN6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPRIN2Q6IMN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPRIN2Q6IMN6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPRIN2Q6IMN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPRIN2Q6IMN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPRIN2Q6IMN6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPRIN2Q6IMN6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPRIN2Q6IMN6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPRIN2Q6IMN6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPRIN2Q6IMN6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPRIN2Q6IMN6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPRIN2Q6IMN6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPRIN2Q6IMN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPRIN2Q6IMN6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPRIN2Q6IMN6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPRIN2Q6IMN6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPRIN2Q6IMN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPRIN2Q6IMN6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPRIN2Q6IMN6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPRIN2Q6IMN6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPRIN2Q6IMN6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPRIN2Q6IMN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPRIN2Q6IMN6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPRIN2Q6IMN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPRIN2Q6IMN6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPRIN2Q6IMN6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPRIN2Q6IMN6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPRIN2Q6IMN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPRIN2Q6IMN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms