Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ANKRD40Q6AI12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ANKRD40Q6AI12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ANKRD40Q6AI12 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ANKRD40Q6AI12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ANKRD40Q6AI12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ANKRD40Q6AI12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ANKRD40Q6AI12 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ANKRD40Q6AI12 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ANKRD40Q6AI12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ANKRD40Q6AI12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ANKRD40Q6AI12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ANKRD40Q6AI12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ANKRD40Q6AI12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ANKRD40Q6AI12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ANKRD40Q6AI12 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ANKRD40Q6AI12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ANKRD40Q6AI12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ANKRD40Q6AI12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ANKRD40Q6AI12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ANKRD40Q6AI12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ANKRD40Q6AI12 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ANKRD40Q6AI12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ANKRD40Q6AI12 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ANKRD40Q6AI12 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ANKRD40Q6AI12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ANKRD40Q6AI12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ANKRD40Q6AI12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ANKRD40Q6AI12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ANKRD40Q6AI12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ANKRD40Q6AI12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ANKRD40Q6AI12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ANKRD40Q6AI12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ANKRD40Q6AI12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ANKRD40Q6AI12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ANKRD40Q6AI12 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ANKRD40Q6AI12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ANKRD40Q6AI12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ANKRD40Q6AI12 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ANKRD40Q6AI12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ANKRD40Q6AI12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ANKRD40Q6AI12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ANKRD40Q6AI12 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ANKRD40Q6AI12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ANKRD40Q6AI12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ANKRD40Q6AI12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ANKRD40Q6AI12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ANKRD40Q6AI12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ANKRD40Q6AI12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD40Q6AI12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ANKRD40Q6AI12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ANKRD40Q6AI12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ANKRD40Q6AI12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ANKRD40Q6AI12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ANKRD40Q6AI12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ANKRD40Q6AI12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ANKRD40Q6AI12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms