Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP1ARQ63HQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP1ARQ63HQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP1ARQ63HQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP1ARQ63HQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP1ARQ63HQ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP1ARQ63HQ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP1ARQ63HQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP1ARQ63HQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP1ARQ63HQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP1ARQ63HQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP1ARQ63HQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP1ARQ63HQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP1ARQ63HQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP1ARQ63HQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP1ARQ63HQ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP1ARQ63HQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP1ARQ63HQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP1ARQ63HQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP1ARQ63HQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP1ARQ63HQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP1ARQ63HQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP1ARQ63HQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP1ARQ63HQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP1ARQ63HQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP1ARQ63HQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP1ARQ63HQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP1ARQ63HQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP1ARQ63HQ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP1ARQ63HQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP1ARQ63HQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1ARQ63HQ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP1ARQ63HQ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP1ARQ63HQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP1ARQ63HQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP1ARQ63HQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP1ARQ63HQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AP1ARQ63HQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP1ARQ63HQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP1ARQ63HQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1ARQ63HQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP1ARQ63HQ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP1ARQ63HQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP1ARQ63HQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP1ARQ63HQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP1ARQ63HQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP1ARQ63HQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AP1ARQ63HQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP1ARQ63HQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP1ARQ63HQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP1ARQ63HQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP1ARQ63HQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP1ARQ63HQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP1ARQ63HQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP1ARQ63HQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP1ARQ63HQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms