Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG85

Putative UPF0633 protein LOC554249, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XG85 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q5XG85 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q5XG85 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5XG85 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5XG85 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5XG85 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5XG85 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q5XG85 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q5XG85 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q5XG85 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q5XG85 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q5XG85 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5XG85 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5XG85 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5XG85 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5XG85 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5XG85 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5XG85 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5XG85 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5XG85 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5XG85 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5XG85 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5XG85 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5XG85 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q5XG85 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q5XG85 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q5XG85 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q5XG85 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q5XG85 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q5XG85 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q5XG85 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q5XG85 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q5XG85 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q5XG85 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q5XG85 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q5XG85 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q5XG85 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q5XG85 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q5XG85 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q5XG85 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q5XG85 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q5XG85 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q5XG85 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q5XG85 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q5XG85 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5XG85 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5XG85 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q5XG85 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q5XG85 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q5XG85 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q5XG85 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q5XG85 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5XG85 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5XG85 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q5XG85 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5XG85 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q5XG85 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q5XG85 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q5XG85 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q5XG85 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5XG85 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q5XG85 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q5XG85 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q5XG85 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q5XG85 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q5XG85 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q5XG85 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q5XG85 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q5XG85 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q5XG85 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q5XG85 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5XG85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5XG85 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5XG85 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5XG85 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5XG85 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5XG85 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5XG85 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5XG85 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5XG85 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q5XG85 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q5XG85 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q5XG85 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q5XG85 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q5XG85 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q5XG85 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5XG85 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5XG85 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q5XG85 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5XG85 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5XG85 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q5XG85 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q5XG85 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q5XG85 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q5XG85 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5XG85 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q5XG85 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q5XG85 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q5XG85 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q5XG85 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms