Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG85

Putative UPF0633 protein LOC554249, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XG85 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q5XG85 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5XG85 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q5XG85 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q5XG85 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q5XG85 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q5XG85 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q5XG85 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q5XG85 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q5XG85 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q5XG85 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5XG85 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q5XG85 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q5XG85 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q5XG85 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q5XG85 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q5XG85 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q5XG85 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q5XG85 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q5XG85 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q5XG85 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q5XG85 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q5XG85 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q5XG85 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q5XG85 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q5XG85 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5XG85 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q5XG85 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q5XG85 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q5XG85 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q5XG85 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q5XG85 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XG85 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XG85 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XG85 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q5XG85 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5XG85 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5XG85 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5XG85 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5XG85 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q5XG85 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5XG85 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5XG85 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5XG85 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5XG85 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q5XG85 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q5XG85 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q5XG85 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q5XG85 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5XG85 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5XG85 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5XG85 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5XG85 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q5XG85 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q5XG85 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q5XG85 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q5XG85 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q5XG85 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q5XG85 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5XG85 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5XG85 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5XG85 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5XG85 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5XG85 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q5XG85 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q5XG85 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q5XG85 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q5XG85 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5XG85 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5XG85 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q5XG85 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q5XG85 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q5XG85 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q5XG85 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q5XG85 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q5XG85 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q5XG85 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q5XG85 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q5XG85 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q5XG85 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5XG85 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q5XG85 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5XG85 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q5XG85 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5XG85 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q5XG85 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q5XG85 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q5XG85 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q5XG85 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q5XG85 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q5XG85 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q5XG85 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q5XG85 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q5XG85 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q5XG85 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q5XG85 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q5XG85 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q5XG85 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q5XG85 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q5XG85 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms