Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACD4Q5VWC8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACD4Q5VWC8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD4Q5VWC8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD4Q5VWC8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD4Q5VWC8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD4Q5VWC8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD4Q5VWC8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD4Q5VWC8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD4Q5VWC8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD4Q5VWC8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD4Q5VWC8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD4Q5VWC8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD4Q5VWC8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD4Q5VWC8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD4Q5VWC8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD4Q5VWC8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD4Q5VWC8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD4Q5VWC8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD4Q5VWC8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HACD4Q5VWC8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD4Q5VWC8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD4Q5VWC8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD4Q5VWC8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD4Q5VWC8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD4Q5VWC8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD4Q5VWC8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACD4Q5VWC8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD4Q5VWC8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD4Q5VWC8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD4Q5VWC8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD4Q5VWC8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACD4Q5VWC8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HACD4Q5VWC8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD4Q5VWC8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD4Q5VWC8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD4Q5VWC8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD4Q5VWC8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD4Q5VWC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACD4Q5VWC8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACD4Q5VWC8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD4Q5VWC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD4Q5VWC8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD4Q5VWC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms