Protein–RNA interactions for Protein: Q5U651

RASIP1, Ras-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASIP1Q5U651 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RASIP1Q5U651 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RASIP1Q5U651 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RASIP1Q5U651 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASIP1Q5U651 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RASIP1Q5U651 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RASIP1Q5U651 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RASIP1Q5U651 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RASIP1Q5U651 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RASIP1Q5U651 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RASIP1Q5U651 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RASIP1Q5U651 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RASIP1Q5U651 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RASIP1Q5U651 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RASIP1Q5U651 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RASIP1Q5U651 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RASIP1Q5U651 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RASIP1Q5U651 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RASIP1Q5U651 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RASIP1Q5U651 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RASIP1Q5U651 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RASIP1Q5U651 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RASIP1Q5U651 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RASIP1Q5U651 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RASIP1Q5U651 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
RASIP1Q5U651 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
RASIP1Q5U651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RASIP1Q5U651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RASIP1Q5U651 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RASIP1Q5U651 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RASIP1Q5U651 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RASIP1Q5U651 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RASIP1Q5U651 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RASIP1Q5U651 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RASIP1Q5U651 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASIP1Q5U651 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RASIP1Q5U651 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RASIP1Q5U651 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RASIP1Q5U651 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RASIP1Q5U651 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RASIP1Q5U651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RASIP1Q5U651 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RASIP1Q5U651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RASIP1Q5U651 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RASIP1Q5U651 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RASIP1Q5U651 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RASIP1Q5U651 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RASIP1Q5U651 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RASIP1Q5U651 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RASIP1Q5U651 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RASIP1Q5U651 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RASIP1Q5U651 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RASIP1Q5U651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
RASIP1Q5U651 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RASIP1Q5U651 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RASIP1Q5U651 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RASIP1Q5U651 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RASIP1Q5U651 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RASIP1Q5U651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RASIP1Q5U651 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RASIP1Q5U651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RASIP1Q5U651 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RASIP1Q5U651 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RASIP1Q5U651 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RASIP1Q5U651 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
RASIP1Q5U651 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RASIP1Q5U651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RASIP1Q5U651 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RASIP1Q5U651 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RASIP1Q5U651 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RASIP1Q5U651 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RASIP1Q5U651 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms