Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXDC1Q5TGL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PXDC1Q5TGL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PXDC1Q5TGL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PXDC1Q5TGL8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PXDC1Q5TGL8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PXDC1Q5TGL8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PXDC1Q5TGL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PXDC1Q5TGL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PXDC1Q5TGL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PXDC1Q5TGL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PXDC1Q5TGL8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PXDC1Q5TGL8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PXDC1Q5TGL8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PXDC1Q5TGL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PXDC1Q5TGL8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXDC1Q5TGL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PXDC1Q5TGL8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PXDC1Q5TGL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PXDC1Q5TGL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PXDC1Q5TGL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PXDC1Q5TGL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PXDC1Q5TGL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PXDC1Q5TGL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms