Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.49■■■■■ 5.35
ERCC6L2Q5T890 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
ERCC6L2Q5T890 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC48.47■■■■■ 5.35
ERCC6L2Q5T890 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
ERCC6L2Q5T890 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
ERCC6L2Q5T890 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
ERCC6L2Q5T890 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
ERCC6L2Q5T890 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
ERCC6L2Q5T890 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
ERCC6L2Q5T890 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
ERCC6L2Q5T890 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
ERCC6L2Q5T890 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
ERCC6L2Q5T890 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.16■■■■■ 5.3
ERCC6L2Q5T890 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.14■■■■■ 5.3
ERCC6L2Q5T890 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
ERCC6L2Q5T890 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
ERCC6L2Q5T890 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47.87■■■■■ 5.25
ERCC6L2Q5T890 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
ERCC6L2Q5T890 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
ERCC6L2Q5T890 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ERCC6L2Q5T890 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
ERCC6L2Q5T890 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
ERCC6L2Q5T890 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
ERCC6L2Q5T890 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.24
ERCC6L2Q5T890 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ERCC6L2Q5T890 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
ERCC6L2Q5T890 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
ERCC6L2Q5T890 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
ERCC6L2Q5T890 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
ERCC6L2Q5T890 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
ERCC6L2Q5T890 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
ERCC6L2Q5T890 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ERCC6L2Q5T890 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ERCC6L2Q5T890 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ERCC6L2Q5T890 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ERCC6L2Q5T890 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6L2Q5T890 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6L2Q5T890 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6L2Q5T890 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
ERCC6L2Q5T890 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.37■■■■■ 5.17
ERCC6L2Q5T890 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.37■■■■■ 5.17
ERCC6L2Q5T890 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ERCC6L2Q5T890 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
ERCC6L2Q5T890 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
ERCC6L2Q5T890 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
ERCC6L2Q5T890 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
ERCC6L2Q5T890 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
ERCC6L2Q5T890 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ERCC6L2Q5T890 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ERCC6L2Q5T890 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ERCC6L2Q5T890 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
ERCC6L2Q5T890 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
ERCC6L2Q5T890 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ERCC6L2Q5T890 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
ERCC6L2Q5T890 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
ERCC6L2Q5T890 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
ERCC6L2Q5T890 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
ERCC6L2Q5T890 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
ERCC6L2Q5T890 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
ERCC6L2Q5T890 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
ERCC6L2Q5T890 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
ERCC6L2Q5T890 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
ERCC6L2Q5T890 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ERCC6L2Q5T890 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ERCC6L2Q5T890 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
ERCC6L2Q5T890 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
ERCC6L2Q5T890 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
ERCC6L2Q5T890 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ERCC6L2Q5T890 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
ERCC6L2Q5T890 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
ERCC6L2Q5T890 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
ERCC6L2Q5T890 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
ERCC6L2Q5T890 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
ERCC6L2Q5T890 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
ERCC6L2Q5T890 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
ERCC6L2Q5T890 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
ERCC6L2Q5T890 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ERCC6L2Q5T890 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ERCC6L2Q5T890 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
ERCC6L2Q5T890 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
ERCC6L2Q5T890 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
ERCC6L2Q5T890 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
ERCC6L2Q5T890 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
ERCC6L2Q5T890 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
ERCC6L2Q5T890 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ERCC6L2Q5T890 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
ERCC6L2Q5T890 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ERCC6L2Q5T890 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ERCC6L2Q5T890 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
ERCC6L2Q5T890 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
ERCC6L2Q5T890 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
ERCC6L2Q5T890 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ERCC6L2Q5T890 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ERCC6L2Q5T890 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ERCC6L2Q5T890 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
ERCC6L2Q5T890 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ERCC6L2Q5T890 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
ERCC6L2Q5T890 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
ERCC6L2Q5T890 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
ERCC6L2Q5T890 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms