Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN52Q52LA3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN52Q52LA3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIN52Q52LA3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN52Q52LA3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN52Q52LA3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN52Q52LA3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIN52Q52LA3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN52Q52LA3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIN52Q52LA3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN52Q52LA3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIN52Q52LA3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIN52Q52LA3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN52Q52LA3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN52Q52LA3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIN52Q52LA3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIN52Q52LA3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN52Q52LA3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN52Q52LA3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN52Q52LA3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIN52Q52LA3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIN52Q52LA3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN52Q52LA3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIN52Q52LA3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIN52Q52LA3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN52Q52LA3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN52Q52LA3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LIN52Q52LA3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN52Q52LA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN52Q52LA3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN52Q52LA3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN52Q52LA3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN52Q52LA3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIN52Q52LA3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN52Q52LA3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN52Q52LA3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIN52Q52LA3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIN52Q52LA3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN52Q52LA3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN52Q52LA3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIN52Q52LA3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms