Protein–RNA interactions for Protein: Q504T8

MIDN, Midnolin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIDNQ504T8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIDNQ504T8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIDNQ504T8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIDNQ504T8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIDNQ504T8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIDNQ504T8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIDNQ504T8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIDNQ504T8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIDNQ504T8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIDNQ504T8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MIDNQ504T8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MIDNQ504T8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MIDNQ504T8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIDNQ504T8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIDNQ504T8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIDNQ504T8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIDNQ504T8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MIDNQ504T8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MIDNQ504T8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIDNQ504T8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIDNQ504T8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIDNQ504T8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIDNQ504T8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIDNQ504T8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIDNQ504T8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIDNQ504T8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIDNQ504T8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIDNQ504T8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIDNQ504T8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms