Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC01559Q495D7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC01559Q495D7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01559Q495D7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC01559Q495D7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC01559Q495D7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC01559Q495D7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01559Q495D7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC01559Q495D7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC01559Q495D7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC01559Q495D7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01559Q495D7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01559Q495D7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC01559Q495D7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01559Q495D7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01559Q495D7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01559Q495D7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01559Q495D7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC01559Q495D7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC01559Q495D7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01559Q495D7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC01559Q495D7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC01559Q495D7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC01559Q495D7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC01559Q495D7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC01559Q495D7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC01559Q495D7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms