Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1644Q3SXP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1644Q3SXP7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1644Q3SXP7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1644Q3SXP7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1644Q3SXP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1644Q3SXP7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1644Q3SXP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1644Q3SXP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1644Q3SXP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIAA1644Q3SXP7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1644Q3SXP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1644Q3SXP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1644Q3SXP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1644Q3SXP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIAA1644Q3SXP7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KIAA1644Q3SXP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIAA1644Q3SXP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1644Q3SXP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIAA1644Q3SXP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KIAA1644Q3SXP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KIAA1644Q3SXP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIAA1644Q3SXP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIAA1644Q3SXP7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1644Q3SXP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIAA1644Q3SXP7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIAA1644Q3SXP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1644Q3SXP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA1644Q3SXP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1644Q3SXP7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1644Q3SXP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIAA1644Q3SXP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIAA1644Q3SXP7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIAA1644Q3SXP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1644Q3SXP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1644Q3SXP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIAA1644Q3SXP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1644Q3SXP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1644Q3SXP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms