Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP21-2Q3LI59 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP21-2Q3LI59 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP21-2Q3LI59 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP21-2Q3LI59 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms