Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP25-1Q3LHN0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP25-1Q3LHN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP25-1Q3LHN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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