Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HFEQ30201 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HFEQ30201 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HFEQ30201 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HFEQ30201 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HFEQ30201 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HFEQ30201 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HFEQ30201 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HFEQ30201 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HFEQ30201 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HFEQ30201 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HFEQ30201 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HFEQ30201 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HFEQ30201 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HFEQ30201 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HFEQ30201 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HFEQ30201 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HFEQ30201 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HFEQ30201 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HFEQ30201 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HFEQ30201 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HFEQ30201 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HFEQ30201 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HFEQ30201 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HFEQ30201 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HFEQ30201 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HFEQ30201 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HFEQ30201 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HFEQ30201 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HFEQ30201 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HFEQ30201 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HFEQ30201 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HFEQ30201 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HFEQ30201 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HFEQ30201 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HFEQ30201 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HFEQ30201 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HFEQ30201 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HFEQ30201 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HFEQ30201 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HFEQ30201 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HFEQ30201 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HFEQ30201 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HFEQ30201 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HFEQ30201 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HFEQ30201 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HFEQ30201 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HFEQ30201 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HFEQ30201 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HFEQ30201 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HFEQ30201 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HFEQ30201 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HFEQ30201 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HFEQ30201 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HFEQ30201 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HFEQ30201 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HFEQ30201 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HFEQ30201 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HFEQ30201 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HFEQ30201 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HFEQ30201 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HFEQ30201 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HFEQ30201 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HFEQ30201 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HFEQ30201 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HFEQ30201 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HFEQ30201 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HFEQ30201 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HFEQ30201 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HFEQ30201 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HFEQ30201 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HFEQ30201 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HFEQ30201 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HFEQ30201 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HFEQ30201 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HFEQ30201 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HFEQ30201 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HFEQ30201 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HFEQ30201 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HFEQ30201 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HFEQ30201 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HFEQ30201 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HFEQ30201 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HFEQ30201 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HFEQ30201 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HFEQ30201 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HFEQ30201 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HFEQ30201 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HFEQ30201 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HFEQ30201 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HFEQ30201 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HFEQ30201 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HFEQ30201 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HFEQ30201 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HFEQ30201 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HFEQ30201 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HFEQ30201 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HFEQ30201 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HFEQ30201 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HFEQ30201 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms