Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAM9

TUSC1, Tumor suppressor candidate gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC1Q2TAM9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUSC1Q2TAM9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUSC1Q2TAM9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUSC1Q2TAM9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUSC1Q2TAM9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUSC1Q2TAM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUSC1Q2TAM9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUSC1Q2TAM9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUSC1Q2TAM9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUSC1Q2TAM9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUSC1Q2TAM9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUSC1Q2TAM9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUSC1Q2TAM9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUSC1Q2TAM9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TUSC1Q2TAM9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUSC1Q2TAM9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUSC1Q2TAM9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUSC1Q2TAM9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUSC1Q2TAM9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUSC1Q2TAM9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUSC1Q2TAM9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUSC1Q2TAM9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUSC1Q2TAM9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUSC1Q2TAM9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUSC1Q2TAM9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUSC1Q2TAM9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUSC1Q2TAM9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUSC1Q2TAM9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUSC1Q2TAM9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUSC1Q2TAM9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUSC1Q2TAM9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUSC1Q2TAM9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TUSC1Q2TAM9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUSC1Q2TAM9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUSC1Q2TAM9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUSC1Q2TAM9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUSC1Q2TAM9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms