Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
COL24A1Q17RW2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
COL24A1Q17RW2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
COL24A1Q17RW2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
COL24A1Q17RW2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
COL24A1Q17RW2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
COL24A1Q17RW2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
COL24A1Q17RW2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
COL24A1Q17RW2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
COL24A1Q17RW2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
COL24A1Q17RW2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
COL24A1Q17RW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
COL24A1Q17RW2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
COL24A1Q17RW2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
COL24A1Q17RW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
COL24A1Q17RW2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
COL24A1Q17RW2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
COL24A1Q17RW2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
COL24A1Q17RW2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
COL24A1Q17RW2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
COL24A1Q17RW2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
COL24A1Q17RW2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
COL24A1Q17RW2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
COL24A1Q17RW2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
COL24A1Q17RW2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
COL24A1Q17RW2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
COL24A1Q17RW2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
COL24A1Q17RW2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
COL24A1Q17RW2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
COL24A1Q17RW2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
COL24A1Q17RW2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
COL24A1Q17RW2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
COL24A1Q17RW2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
COL24A1Q17RW2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
COL24A1Q17RW2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
COL24A1Q17RW2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
COL24A1Q17RW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
COL24A1Q17RW2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
COL24A1Q17RW2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
COL24A1Q17RW2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
COL24A1Q17RW2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
COL24A1Q17RW2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
COL24A1Q17RW2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
COL24A1Q17RW2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
COL24A1Q17RW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
COL24A1Q17RW2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
COL24A1Q17RW2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
COL24A1Q17RW2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
COL24A1Q17RW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
COL24A1Q17RW2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
COL24A1Q17RW2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
COL24A1Q17RW2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
COL24A1Q17RW2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
COL24A1Q17RW2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
COL24A1Q17RW2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
COL24A1Q17RW2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
COL24A1Q17RW2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
COL24A1Q17RW2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
COL24A1Q17RW2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
COL24A1Q17RW2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
COL24A1Q17RW2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
COL24A1Q17RW2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
COL24A1Q17RW2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
COL24A1Q17RW2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
COL24A1Q17RW2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
COL24A1Q17RW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
COL24A1Q17RW2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
COL24A1Q17RW2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
COL24A1Q17RW2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COL24A1Q17RW2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COL24A1Q17RW2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
COL24A1Q17RW2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
COL24A1Q17RW2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL24A1Q17RW2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
COL24A1Q17RW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms