Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL8BQ17RB0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL8BQ17RB0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL8BQ17RB0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL8BQ17RB0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL8BQ17RB0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL8BQ17RB0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL8BQ17RB0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTL8BQ17RB0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL8BQ17RB0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL8BQ17RB0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL8BQ17RB0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL8BQ17RB0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL8BQ17RB0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL8BQ17RB0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms