Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLPPQ16740 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLPPQ16740 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLPPQ16740 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLPPQ16740 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLPPQ16740 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLPPQ16740 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLPPQ16740 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLPPQ16740 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLPPQ16740 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLPPQ16740 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLPPQ16740 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLPPQ16740 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLPPQ16740 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLPPQ16740 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLPPQ16740 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLPPQ16740 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLPPQ16740 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLPPQ16740 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLPPQ16740 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLPPQ16740 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLPPQ16740 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLPPQ16740 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLPPQ16740 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLPPQ16740 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLPPQ16740 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLPPQ16740 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLPPQ16740 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CLPPQ16740 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLPPQ16740 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLPPQ16740 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLPPQ16740 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLPPQ16740 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLPPQ16740 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLPPQ16740 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLPPQ16740 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLPPQ16740 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CLPPQ16740 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLPPQ16740 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLPPQ16740 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLPPQ16740 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLPPQ16740 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLPPQ16740 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLPPQ16740 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLPPQ16740 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLPPQ16740 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLPPQ16740 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLPPQ16740 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLPPQ16740 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLPPQ16740 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLPPQ16740 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLPPQ16740 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLPPQ16740 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLPPQ16740 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLPPQ16740 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLPPQ16740 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLPPQ16740 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLPPQ16740 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLPPQ16740 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLPPQ16740 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLPPQ16740 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLPPQ16740 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLPPQ16740 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLPPQ16740 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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