Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STX1AQ16623 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STX1AQ16623 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
STX1AQ16623 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STX1AQ16623 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STX1AQ16623 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STX1AQ16623 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STX1AQ16623 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
STX1AQ16623 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
STX1AQ16623 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
STX1AQ16623 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
STX1AQ16623 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
STX1AQ16623 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
STX1AQ16623 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
STX1AQ16623 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
STX1AQ16623 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STX1AQ16623 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
STX1AQ16623 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
STX1AQ16623 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
STX1AQ16623 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STX1AQ16623 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STX1AQ16623 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
STX1AQ16623 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
STX1AQ16623 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
STX1AQ16623 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
STX1AQ16623 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
STX1AQ16623 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
STX1AQ16623 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
STX1AQ16623 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
STX1AQ16623 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
STX1AQ16623 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
STX1AQ16623 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
STX1AQ16623 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
STX1AQ16623 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
STX1AQ16623 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
STX1AQ16623 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STX1AQ16623 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
STX1AQ16623 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STX1AQ16623 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
STX1AQ16623 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX1AQ16623 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX1AQ16623 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
STX1AQ16623 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
STX1AQ16623 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
STX1AQ16623 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
STX1AQ16623 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STX1AQ16623 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
STX1AQ16623 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
STX1AQ16623 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms