Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAPC1Q16533 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAPC1Q16533 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC1Q16533 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC1Q16533 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC1Q16533 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC1Q16533 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC1Q16533 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC1Q16533 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNAPC1Q16533 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC1Q16533 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC1Q16533 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC1Q16533 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC1Q16533 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC1Q16533 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC1Q16533 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAPC1Q16533 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAPC1Q16533 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAPC1Q16533 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAPC1Q16533 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAPC1Q16533 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAPC1Q16533 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAPC1Q16533 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAPC1Q16533 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC1Q16533 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC1Q16533 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC1Q16533 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC1Q16533 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC1Q16533 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC1Q16533 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC1Q16533 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAPC1Q16533 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC1Q16533 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAPC1Q16533 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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