Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZIC1Q15915 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZIC1Q15915 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZIC1Q15915 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZIC1Q15915 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZIC1Q15915 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZIC1Q15915 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZIC1Q15915 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZIC1Q15915 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZIC1Q15915 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZIC1Q15915 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZIC1Q15915 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZIC1Q15915 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZIC1Q15915 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZIC1Q15915 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZIC1Q15915 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZIC1Q15915 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZIC1Q15915 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZIC1Q15915 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZIC1Q15915 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZIC1Q15915 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZIC1Q15915 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZIC1Q15915 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZIC1Q15915 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZIC1Q15915 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZIC1Q15915 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZIC1Q15915 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZIC1Q15915 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZIC1Q15915 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZIC1Q15915 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZIC1Q15915 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZIC1Q15915 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZIC1Q15915 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZIC1Q15915 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZIC1Q15915 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZIC1Q15915 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZIC1Q15915 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZIC1Q15915 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZIC1Q15915 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZIC1Q15915 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZIC1Q15915 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZIC1Q15915 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZIC1Q15915 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZIC1Q15915 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZIC1Q15915 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZIC1Q15915 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZIC1Q15915 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZIC1Q15915 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZIC1Q15915 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZIC1Q15915 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZIC1Q15915 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZIC1Q15915 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZIC1Q15915 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms