Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMAD1Q15797 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMAD1Q15797 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMAD1Q15797 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMAD1Q15797 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMAD1Q15797 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMAD1Q15797 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMAD1Q15797 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMAD1Q15797 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMAD1Q15797 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMAD1Q15797 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD1Q15797 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMAD1Q15797 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMAD1Q15797 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMAD1Q15797 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMAD1Q15797 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMAD1Q15797 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMAD1Q15797 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMAD1Q15797 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMAD1Q15797 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD1Q15797 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD1Q15797 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMAD1Q15797 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD1Q15797 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD1Q15797 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMAD1Q15797 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMAD1Q15797 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMAD1Q15797 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD1Q15797 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD1Q15797 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMAD1Q15797 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD1Q15797 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMAD1Q15797 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMAD1Q15797 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD1Q15797 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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