Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWIST1Q15672 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST1Q15672 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST1Q15672 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST1Q15672 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST1Q15672 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWIST1Q15672 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TWIST1Q15672 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWIST1Q15672 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST1Q15672 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWIST1Q15672 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWIST1Q15672 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWIST1Q15672 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWIST1Q15672 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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TWIST1Q15672 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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TWIST1Q15672 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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TWIST1Q15672 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWIST1Q15672 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TWIST1Q15672 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWIST1Q15672 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWIST1Q15672 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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