Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SKIV2LQ15477 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SKIV2LQ15477 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SKIV2LQ15477 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SKIV2LQ15477 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SKIV2LQ15477 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SKIV2LQ15477 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SKIV2LQ15477 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKIV2LQ15477 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SKIV2LQ15477 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SKIV2LQ15477 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKIV2LQ15477 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SKIV2LQ15477 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKIV2LQ15477 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKIV2LQ15477 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKIV2LQ15477 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SKIV2LQ15477 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SKIV2LQ15477 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SKIV2LQ15477 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SKIV2LQ15477 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKIV2LQ15477 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKIV2LQ15477 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKIV2LQ15477 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SKIV2LQ15477 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SKIV2LQ15477 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SKIV2LQ15477 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SKIV2LQ15477 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SKIV2LQ15477 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SKIV2LQ15477 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKIV2LQ15477 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKIV2LQ15477 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SKIV2LQ15477 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SKIV2LQ15477 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SKIV2LQ15477 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SKIV2LQ15477 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SKIV2LQ15477 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SKIV2LQ15477 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SKIV2LQ15477 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SKIV2LQ15477 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SKIV2LQ15477 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SKIV2LQ15477 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SKIV2LQ15477 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SKIV2LQ15477 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SKIV2LQ15477 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SKIV2LQ15477 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SKIV2LQ15477 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SKIV2LQ15477 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SKIV2LQ15477 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SKIV2LQ15477 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SKIV2LQ15477 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SKIV2LQ15477 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SKIV2LQ15477 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SKIV2LQ15477 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SKIV2LQ15477 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SKIV2LQ15477 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SKIV2LQ15477 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SKIV2LQ15477 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SKIV2LQ15477 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SKIV2LQ15477 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SKIV2LQ15477 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SKIV2LQ15477 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SKIV2LQ15477 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SKIV2LQ15477 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKIV2LQ15477 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SKIV2LQ15477 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SKIV2LQ15477 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKIV2LQ15477 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SKIV2LQ15477 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SKIV2LQ15477 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SKIV2LQ15477 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SKIV2LQ15477 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SKIV2LQ15477 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SKIV2LQ15477 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SKIV2LQ15477 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKIV2LQ15477 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SKIV2LQ15477 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms