Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 23.6
SAFBQ15424 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 23.2
SAFBQ15424 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 23.2
SAFBQ15424 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 23.2
SAFBQ15424 CHST15-204ENST00000476765 436 ntTSL 39.68□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 23.2
SAFBQ15424 AC124312.1-202ENST00000557230 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.95□□□□□ -1.143e-7■■■■□ 23.1
SAFBQ15424 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 23.1
SAFBQ15424 SNHG14-214ENST00000551361 550 ntTSL 35.56□□□□□ -1.523e-7■■■■□ 23.1
SAFBQ15424 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 526.88■■□□□ 1.891e-6■■■■□ 22.7
SAFBQ15424 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 326.29■■□□□ 1.81e-6■■■■□ 22.7
SAFBQ15424 FAM208B-213ENST00000532424 433 ntTSL 322.38■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 22.7
SAFBQ15424 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 321.56■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 22.7
SAFBQ15424 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81e-6■■■■□ 22.7
SAFBQ15424 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 22.7
SAFBQ15424 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)26.05■■□□□ 1.764e-6■■■■□ 22.6
SAFBQ15424 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.964e-6■■■■□ 22.6
SAFBQ15424 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.864e-6■■■■□ 22.6
SAFBQ15424 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 22.6
SAFBQ15424 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 22.6
SAFBQ15424 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 510.95□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 22.6
SAFBQ15424 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 22.4
SAFBQ15424 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 22.4
SAFBQ15424 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-7■■■■□ 22.4
SAFBQ15424 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.252e-7■■■■□ 22.4
SAFBQ15424 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.832e-7■■■■□ 22.4
SAFBQ15424 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 21.9
SAFBQ15424 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.83□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 21.9
SAFBQ15424 USP48-206ENST00000464577 2089 ntTSL 28.3□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 21.9
SAFBQ15424 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.364e-7■■■■□ 21.9
SAFBQ15424 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.124e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 521.03■□□□□ 0.964e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.254e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.114e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.064e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 SFSWAP-202ENST00000535202 567 ntTSL 29.53□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 21.8
SAFBQ15424 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 21.7
SAFBQ15424 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 524.02■■□□□ 1.445e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-245ENST00000592481 1291 ntTSL 523.93■■□□□ 1.425e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 422.98■■□□□ 1.275e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.085e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.925e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 420.08■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.745e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.75e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 218.71■□□□□ 0.595e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.55e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 417.17■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.25e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-212ENST00000586128 752 ntTSL 416■□□□□ 0.155e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -05e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-210ENST00000479364 1010 ntTSL 514.07□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 413.89□□□□□ -0.195e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 413.73□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 213.13□□□□□ -0.315e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 512.77□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 412.68□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 411.63□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.945e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-214ENST00000496712 603 ntTSL 35.64□□□□□ -1.515e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 35.5□□□□□ -1.535e-7■■■■□ 21.6
SAFBQ15424 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)26.15■■□□□ 1.787e-7■■■■□ 21.4
SAFBQ15424 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.347e-7■■■■□ 21.4
SAFBQ15424 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.989e-7■■■■□ 21.1
SAFBQ15424 MON2-205ENST00000547095 5708 ntTSL 1 (best)20.26■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.817e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.737e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.77e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC12.84□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.877e-7■■■■□ 21
SAFBQ15424 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.141e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 35.99□□□□□ -1.451e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 34.59□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 20.9
SAFBQ15424 NOL3-206ENST00000564992 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.43■■□□□ 1.188e-9■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.178e-9■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 NOL3-203ENST00000563439 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.3■■□□□ 1.168e-9■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.928e-9■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 NOL3-208ENST00000565645 519 ntTSL 420.67■□□□□ 0.98e-9■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 NOL3-207ENST00000565560 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.52■□□□□ 0.728e-9■■■■□ 20.8
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