Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPAQ15257 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPAQ15257 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPAQ15257 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPAQ15257 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPAQ15257 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPAQ15257 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPAQ15257 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPAQ15257 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPAQ15257 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPAQ15257 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPAQ15257 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPAQ15257 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPAQ15257 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPAQ15257 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPAQ15257 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPAQ15257 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPAQ15257 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPAQ15257 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPAQ15257 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPAQ15257 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPAQ15257 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPAQ15257 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPAQ15257 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPAQ15257 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPAQ15257 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPAQ15257 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPAQ15257 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPAQ15257 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPAQ15257 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPAQ15257 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPAQ15257 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPAQ15257 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPAQ15257 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPAQ15257 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPAQ15257 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPAQ15257 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPAQ15257 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPAQ15257 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPAQ15257 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPAQ15257 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPAQ15257 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPAQ15257 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPAQ15257 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPAQ15257 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPAQ15257 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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PTPAQ15257 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPAQ15257 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPAQ15257 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPAQ15257 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPAQ15257 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPAQ15257 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPAQ15257 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPAQ15257 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPAQ15257 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPAQ15257 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPAQ15257 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPAQ15257 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
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