Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCF4Q15080 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCF4Q15080 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCF4Q15080 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCF4Q15080 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCF4Q15080 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCF4Q15080 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCF4Q15080 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCF4Q15080 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCF4Q15080 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCF4Q15080 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCF4Q15080 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCF4Q15080 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCF4Q15080 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCF4Q15080 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCF4Q15080 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCF4Q15080 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCF4Q15080 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCF4Q15080 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCF4Q15080 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCF4Q15080 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCF4Q15080 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCF4Q15080 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCF4Q15080 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCF4Q15080 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCF4Q15080 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCF4Q15080 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCF4Q15080 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCF4Q15080 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCF4Q15080 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCF4Q15080 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCF4Q15080 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCF4Q15080 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCF4Q15080 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCF4Q15080 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCF4Q15080 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCF4Q15080 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCF4Q15080 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NCF4Q15080 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCF4Q15080 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NCF4Q15080 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCF4Q15080 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCF4Q15080 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCF4Q15080 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCF4Q15080 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCF4Q15080 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCF4Q15080 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCF4Q15080 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCF4Q15080 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCF4Q15080 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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