Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF3Q14653 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF3Q14653 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRF3Q14653 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF3Q14653 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF3Q14653 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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