Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF3Q14653 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRF3Q14653 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRF3Q14653 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IRF3Q14653 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRF3Q14653 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRF3Q14653 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRF3Q14653 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
IRF3Q14653 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRF3Q14653 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRF3Q14653 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRF3Q14653 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IRF3Q14653 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF3Q14653 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF3Q14653 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF3Q14653 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF3Q14653 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF3Q14653 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF3Q14653 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF3Q14653 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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